第1部のフラグ付きルート

「ライトニングＳパック」のフラグは撃墜数によって決定されるため、10話の前に3話である程度、ムウの撃墜数を稼いでおいたほうがよい。同様に2部（39話）の「EDFソリッドアーマー」フラグもこの1部の4話、10話で陽子の撃墜数を稼いでおいた方がいい。


第1部のフラグルート | 第2部のフラグルート


第1話
宇宙の海に帆をあげろ
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第2話
白き鉄騎士たち
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第3話
ミッション『ナデシコ破壊指令』
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第4話
砕け散る希望
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第5話
機界・機械・奇々怪々
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第6話
ＧＧＧ危機一髪
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第7話
『出会いと別れ』の赤い星
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第8話
沖縄の一番暑い日

■ ボン太くん加入フラグ1
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宇宙でナデシコを護衛
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地上でハイジャックに対処
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第9話
最悪な災厄の採択
戦うボーイズ・アンド・ガールズ
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第10話
赤と白の悪魔

■ ライトニングＳパック加入フラグ1
■ テッカマンレイピア【レイピア】加入フラグ1
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日本でDr.ヘルに備える
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北米でＤボゥイを救出する
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第11話
魔神相打つ
心求めて
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1周目プレイ
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2周目プレイ
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第12話
放送不可のウォークライ

■ ボン太くん加入フラグ2
『館長』は誰だ！　『教授』は誰だ！
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第13話
『秘密のバイト』は危険な香り
友情のファニーアニマルズ

■ ボン太くん加入フラグ2
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第14話
その生命、誰がために
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第15話
五色の絆、金色の勇気
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第16話
閉ざされた二人
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第17話
さらば勇者達！東京大決戦!!

■ テッカマンレイピア【レイピア】加入フラグ2
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第18話
悲劇のワン・ナイト・スタンド
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第19話
激突！魔神VS地獄王
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第20話
加速する宇宙
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第21話
送られてきた刺客

■ テッカマンレイピア【レイピア】加入フラグ3
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火星の遺跡調査に向かう
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月でナデシコの護衛に付く
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第22話
過去からの帰還者
やってきた『遠い同胞』
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第23話
終わらない円舞曲・終幕
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第24話
それぞれの『自分らしく』

■ ダイテツジン加入フラグ1
■ エステバリスIIアカツキ【アカツキ】加入フラグ1
■ アルストロメリア【元一朗】加入フラグ1
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第25話
木星決戦！超重力の罠
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第26話
勇気ある戦い
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第27話
そして、終わらない明日へ



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