進化するポケモン
ポケモンはレベルが上がると進化して、姿かたちが変わる。進化したポケモンは総じてもとのポケモンより強く、冒険を楽に勧めるため、ポケモンずかんを完成させるためには積極的に進化をして行こう。
進化させるための条件には「レベルを上げる」「特定のアイテムを使う」「通信をする」といったものがある。
レベルを上げて進化させるのが基本。ちなみに進化途中でBボタンを押せば進化キャンセルが起こる。ポケモンは進化するとわざの覚えるレベルが遅くなったりするのであえて進化をさせないのも手ではある。次のレベルになったら、また進化が始まるので安心しよう。
通信交換をすることで進化するポケモンは、ひとりではもうどうしようもない。ポケモンずかんを完成させるためには、このように通信が不可欠なのである。
またぜんこくずかん入手後は、特定のポケモンに特定のアイテムを持たせて通信交換することで進化するポケモンもいる。
ぜんこくずかん入手後はカントー地方のポケモン（1〜150）の一部も新たに進化できるようになる。前述の特定のアイテムを持たせての通信のほか、なつき度が一定値以上だと進化するポケモンがいる。
アイテムを使う進化（たいようのいしのみ、全国図鑑入手後に可能）
| アイテム名 | 進化するポケモン |
| つきのいし | ニドリーナ/ニドリーノ/ピッピ/プリン |
| ほのおのいし | ロコン/ガーディ/イーブイ |
| みずのいし | ニョロゾ/シェルダー/ヒトデマン/イーブイ |
| かみなりのいし | ピカチュウ/イーブイ |
| リーフのいし | クサイハナ/ウツドン/タマタマ |
| たいようのいし | クサイハナ |
通信で進化（通常以外は全国図鑑入手後に可能）
| 備考 | 進化するポケモン |
| 通常 | ユンゲラー/ゴーリキー/ゴローン/ゴースト |
| +おうじゃのしるし | ニョロゾ/ヤドン |
| +メタルコート | イワーク/ストライク |
| +りゅうのウロコ | シードラ |
| +アップグレード | ポリゴン |
なつき度が一定値以上で進化（全国図鑑入手後に可能）
カントー地方の進化一覧
| 第1形態 | ⇒進化条件 | 第2形態 | ⇒進化条件 | 第3形態 |
| フシギダネ | LV:16 | フシギソウ | LV:32 | フシギバナ |
| ヒトカゲ | LV:16 | リザード | LV: | リザードン |
| ゼニガメ | LV:16 | カメール | LV:36 | カメックス |
| キャタピー | LV:7 | トランセル | LV:10 | バタフリー |
| ビードル | LV:7 | コクーン | LV:10 | スピアー |
| ポッポ | LV:18 | ピジョン | LV:36 | ピジョット |
| コラッタ | LV:20 | ラッタ | | |
| オニスズメ | LV:20 | オニドリル | | |
| アーボ | LV:22 | アーボック | | |
| ピカチュウ | かみなりのいし | ライチュウ | | |
| サンド | LV:22 | サンドパン | | |
| ニドラン♀ | LV:16 | ニドリーナ | つきのいし | ニドクイン |
| ニドラン♂ | LV:16 | ニドリーノ | つきのいし | ニドキング |
| ピッピ | つきのいし | ピクシー | | |
| ロコン | ほのおのいし | キュウコン | | |
| プリン | つきのいし | プクリン | | |
| ズバット | LV:22 | ゴルバット | | |
| パラス | LV:24 | パラセクト | | |
| ナゾノクサ | LV:21 | クサイハナ | リーフのいし | ラフレシア |
| コンパン | LV:31 | モルフォン | | |
| ディグダ | LV:26 | ダグトリオ | | |
| ニャース | LV:28 | ペルシアン | | |
| コダック | LV:33 | ゴルダック | | |
| マンキー | LV:28 | オコリザル | | |
| ガーディ | ほのおのいし | ウインディ | | |
| ニョロモ | LV:25 | ニョロゾ | みずのいし | ニョロボン |
| ケーシィ | LV:16 | ユンゲラー | 通信交換 | フーディン |
| ワンリキー | LV:28 | ゴーリキー | 通信交換 | カイリキー |
| マダツボミ | LV:21 | ウツドン | リーフのいし | ウツボット |
| メノクラゲ | LV:30 | ドククラゲ | | |
| イシツブテ | LV:25 | ゴローン | 通信交換 | ゴローニャ |
| ポニータ | LV:40 | ギャロップ | | |
| ヤドン | LV:37 | ヤドラン | | |
| コイル | LV:30 | レアコイル | | |
| ドード | LV:31 | ドードリオ | | |
| パウワウ | LV:34 | ジュゴン | | |
| ベトベター | LV:38 | ベトベトン | | |
| シェルダー | みずのいし | パルシェン | | |
| ゴース | LV:25 | ゴースト | 通信交換 | ゲンガー |
| スリープ | LV:26 | スリーパー | | |
| クラブ | LV:28 | キングラー | | |
| ビリリダマ | LV:30 | マルマイン | | |
| タマタマ | リーフのいし | ナッシー | | |
| カラカラ | LV:28 | ガラガラ | | |
| ドガース | LV:35 | マタドガス | | |
| サイホーン | LV:42 | サイドン | | |
| タッツー | LV:32 | シードラ | | |
| トサキント | LV:33 | アズマオウ | | |
| ヒトデマン | みずのいし | スターミー | | |
| コイキング | LV:20 | ギャラドス | | |
| イーブイ | みずのいし | シャワーズ | | |
| かみなりのいし | サンダース | | |
| ほのおのいし | ブースター | | |
| オムナイト | LV:40 | オムスター | | |
| カブト | LV:40 | カブトプス | | |
| ミニリュウ | LV:30 | ハクリュー | LV:55 | カイリュー |