● スタートからエンディングまでの道程です。
● クリア後は下記のクリア後へ進んでください。

クリア前 / クリア後

マサラタウン
■ 町の北の林から進もうとすると、オーキド博士登場。
■ オーキド博士の家でポケモンをもらう。「ヒトカゲ」、「ゼニガメ」、「フシギダネ」のうち１体がもらえる。そのままライバルと戦闘。
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トキワシティ
■ フレンドリィショップで店員から『おとどけもの』をもらう。
※ トキワシティへはマサラタウンから１ばんどうろを通っていく。
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マサラタウン
■ オーキド博士の家で、オーキドから『ポケモンずかん』と『モンスターボール』を入手。
■ ライバルの家で、ナナミから『タウンマップ』を入手。
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トキワシティ
■ 町の中央あたりにいるおじいさんから『おしえテレビ』を入手。
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22ばんどうろ
■ ライバルと戦闘。
※ ここは無視してトキワのもりへ行ってもいい。なお、22ばんどうろは、トキワシティの西からいける。
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ハナダのもり（2ばんどうろ）
■ 通り抜ける。
※ 2ばんどうろはトキワシティの北にある。
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ニビシティ
■ ポケモンジムでタケシと戦闘。『グレーバッジ』と『わざマシン39』を入手。
■ 3ばんどうろ入り口にいるオーキドの助手から『ランニングシューズ』を入手。
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オツキミやま
■ 地下2階で研究員と戦闘。「かいのカセキ」か「こうらのカセキ」のどちらかを入手。
※ オツキミやまへは、ニビシティの東にある3ばんどうろから行ける。オツキミやまを経由して4ばんどうろへ出よう。そこから東へ進めば次の目的地ハナダシティだ。
※ カセキはどちらかしか取れない。それぞれ特定のポケモン入手に必要で、1プレイでどちらか一匹を選ぶということになる。
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ハナダシティ
■ 北の24ばんどうろへ進むと、ライバルとバトル。勝利後、『ボイスチェッカー』を入手。
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25ばんどうろ
■ マサキの家でイベント。『ふねのチケット』を入手。
※ マサキの家は24ばんどうろから道なりに進んでいき、25ばんどうろの奥にある。
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ハナダシティ
■ ポケモンジムでカスミと戦闘。『ブルーバッジ』と『わざマシン03』を入手。
■ 北東の家を抜けて、そこにいるロケットだんと戦闘。『わざマシン28』を入手。
※ 次のクチバシティへは上記の民家を抜けた後、南下。5ばんどうろへ行き、そこから地下通路を通って、6ばんどうろへと抜ける。
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クチバシティ
■ ポケモンセンターにいる女の子から『バトルサーチャー』、民家にいるポケモン大好きクラブ会長から『ひきかえけん』、民家にいる釣りオヤジから『ボロのつりざお』を入手。
※ 次は南に停泊しているサント・アンヌごうの中へ。
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サント・アンヌごう
■ 2階でライバルと戦闘。
■ 3階の船長の部屋で船長から『ひでんマシン01』を入手 。
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クチバシティ
■ ポケモンジムでマチスと戦闘。『オレンジバッジ』と『わざマシン34』を入手。
※ マチスのいるジムへは「いあいぎり」を覚えているポケモンが必要。ひでんマシン01で手持ちポケモンにいあいぎりを覚えさせよう。
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ディグダのあな（11ばんどうろ）
■ 通り抜ける。通り抜けた先は2ばんどうろ。
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2ばんどうろ
■ ディグダのあなを抜けた先の家で、オーキドの助手から『ひでんマシン05』を入手。
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ニビシティ
■ 科学博物館の裏口から入ると（いあいぎりが必要）、研究員から『ひみつのコハク』を入手できる。
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ハナダシティ
■ 自転車屋で「ひきかえけん」と引き換えに、『じてんしゃ』を入手。
※ 次はこのハナダシティの東の9ばんどうろへいき、そこからイワヤマトンネルへ入る。
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イワヤマトンネル
■ 通り抜ける。暗いので「フラッシュ」を覚えているポケモンで明るくして進もう。ひでんマシン05で手持ちポケモンにフラッシュを覚えさせよう。ちなみにフラッシュがなくても、マップを把握できていれば、通り抜けることはできる。
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シオンタウン
※ 情報収集。ポケモンタワーは現時点では途中までしか進めない。次は西にある8ばんどうろへ行き、そこから地下通路をとおり、タマムシシティへ。
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タマムシシティ
■ タマムシマンションへ行き、管理人から『おちゃ』を入手。さらに裏口から入って最上階へ行くと、「イーブイ」を手に入れることができる。
■ 食堂にいるおじさんから『コインケース』を入手。
■ ポケモンジムでエリカと戦闘。『レインボーバッジ』と『わざマシン19』を入手。
■ ゲームセンターの壁に貼ってあるポスターを調べ、アジトの中へ入る。
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ロケットだんのアジト
■ 地下4階でロケットだんと戦闘。『エレベータのカギ』を入手。
■ 地下4階でサカキと戦闘。『シルフスコープ』を入手。
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7ばんどうろ
■ 警備員に『おちゃ』をわたし、ヤマブキシティの中に入れるようにする。
※ 7ばんどうろである必要はないが、タマムシシティの西にある7ばんどうろが一番近い。
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ヤマブキシティ
■ 格闘道場でかくとうおうと戦闘。「サワムラー」か「エビワラー」を入手。
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ポケモンタワー（シオンタウン）
■ 6階でガラガラと戦闘。
■ 7階でロケットだんと戦闘。フジ老人から『ポケモンのふえ』を入手。
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シルフカンパニー（ヤマブキシティ）
■ 5階で『カードキー』を入手。
■ 7階でライバルとバトル。『ラプラス』がもらえる。
■ 11階でサカキとバトル。社長から『マスターボール』を入手。
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ヤマブキシティ
■ ポケモンジムでナツメと戦闘。『ゴールドバッジ』と『わざマシン04』を入手。
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サファリゾーン（セキチクシティ）
■ 第3エリアで『きんのいれば』を入手。
■ 第3エリアの奥の小屋で『ひでんマシン03』を入手。
※ セキチクシティにはタマムシシティ西の16ばんどうろ、あるいはシオンタウン南の12ばんどうろから行く。 どちらの場合もポケモンのふえでカビゴンと戦闘する必要がある。カビゴンはこの2体しか出てこないので、1体は捕まえておきたい。なお、16ばんどうろでは『ひでんマシン02』を、12ばんどうろでは『すごいつりざお』を入手できる。
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セキチクシティ
■ 釣りオヤジの兄から『いいつりざお』を入手。
■ 園長に「きんのいれば」を渡し、『ひでんマシン04』を入手。
■ ポケモンジムでキョウと戦闘。『ピンクバッジ』と『わざマシン06』を入手。
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むじんはつでんしょ
■ 伝説のポケモン「サンダー」を捕まえる。
※ ハナダシティ東の9ばんどうろ、10ばんどうろから来ることができる。途中で「なみのり」が必要。
※ クリアには関係ないので、サンダーがいらなければ来る必要はない。サンダーは逃すと二度と手に入らない。
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ふたごじま
■ 伝説のポケモン「フリーザー」を捕まえる。
■ 通り抜けて、グレンじまへ。
※ ふたごじまへはセキチクシティ南の19ばんすいどうから、「なみのり」をつかうことによっていくことができる。グレンじまへは、そのほかにマサラタウン南の21ばんすいどうを使う手もある。こちらはふたごじまを経由しないので、すぐに到着する。
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グレンじま
■ ポケモンやしきへ進む。
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ポケモンやしき
■ 地下1階で『ひみつのカギ』を入手。
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グレンじま
■ ポケモンジムでカツラと戦闘。『クリムゾンバッジ』と『わざマシン38』を入手。
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１のしま
■ マサキから『いんせき』、ニシキから『トライパス』を入手。
※ グレンじまからマサキに連れられてくる。「いいえ」を選んでしまった場合でもグレンじまのポケモンセンターにいけばマサキがいるので大丈夫。トライパス入手後はクチバシティの港から来ることができる。
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ともしびおんせん
■ おじいさんから『ひでんマシン06』を入手。
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ともしびやま
■ 伝説のポケモン「ファイヤー」を捕まえる。
※ クリアには関係ないので、ファイヤーがいらなければ来る必要はない。ファイヤーは逃すと二度と手に入らない。
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２のしま
■ ゲームコーナーの主人に話す。
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３のしま
■ ぼうそうぞくと連続バトル。
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きのみのもり
■ 奥にいるマヨちゃんと話す。スリーパーと戦闘。
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２のしま
■ ゲームコーナーの主人に話し、『つきのいし』を入手。
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１のしま
■ マサキの用事が終了。
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トキワシティ
■ ポケモンジムでサカキと戦闘。『グリーンバッジ』と『わざマシン26』を入手。
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22ばんどうろ
■ ライバルと戦闘。
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チャンピオンロード
■ 通り抜ける。
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セキエイこうげん
■ カンナ、シバ、キクコ、ワタル、ライバルと5連続で戦闘。
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エンディング
■ セーブして始めるとマサラタウンからスタート。

この時点でのチェックポイント
→ 60匹以上のポケモンを捕まえていた場合、オーキドの家でオーキドが、ずかんを「ぜんこくずかん」にパワーアップしてくれる。