■■ユニット、隠しキャラクター編■■
量産型νガンダム
フラグ1-第１話終了後、逆シャアルートを選択。
フラグ2-第32話開始前に量産型νガンダムが参戦する。
高機動型ブラックサレナ
フラグ1-第１話終了後、ナデシコルートを選択。
フラグ2-第32話開始前に高機動型ブラックサレナが参戦する。
量産型νガンダムI
フラグ1-第２話（逆シャアルート）で「７ターン以内にフィフス・ルナに到達」する。
フラグ2-第３話（逆シャアルート）でケーラのユニットが量産型νガンダム（通常はジェガン）に変更される。
ガンダムMk-III
フラグ1-第４話（逆シャアルート）でハサウェイが生存状態時に、チェーン機でクェス機を撃墜。
フラグ2-第20話でフォウのユニットがガンダムMk-III（通常はジェガン）に変更される。
ガンダムレオパルドＳ−１
フラグ1-第12話終了後、フリーデンルートを選択すると、第13話からガンダムレオパルドＳ−１へと換装できる。
キュベレイMk-II【プル】
フラグ1-第22話（宇宙ルート）で、ジュドーがプルを2回説得するとキュベレイMk-II【プル】が参戦する。ただし、それまでジュドーはプルを攻撃してはいけない（反撃は可能）。
キュベレイMk-II【プルツー】
フラグ1-第22話（宇宙ルート）で【プル】を仲間にしている。
フラグ2-第29話（宇宙ルート）でジュドーとプルが、それぞれプルと戦闘をする。その後、ジュドーでプルツーを説得する。ただし、それまでにグレミーを撃墜していること。
フェブラル
フラグ1-第22話（宇宙ルート）クリア時点でジャミルの撃墜数が20機以上である場合、フェブラルが参戦する。
マスターガンダム【東方不敗】
フラグ1-第26話でデビルガンダム【東方不敗】を、撤退させずに撃墜する（ＨＰ30パーセント以下で撤退）。
フラグ2-第27話で、巨大ゴールが出現後、真ゲッターのＨＰを30パーセント以下にする。（真ゲッターの武器追加イベントが発生）
フラグ3-第28話でマスターガンダム【東方不敗】が参戦する。
クラウダ【ランスロー】
フラグ1-第29話（宇宙ルート）でジャミルとランスローが戦闘をする。
フラグ2-第30話（宇宙ルート）でジャミルとランスローが戦闘をし、ジャミルでランスローを説得する。
【ティファ】
フラグ1-第31話（宇宙ルート）終了後に【ティファ】がサブパイロットとして参戦する。
アルストロメリア
フラグ1-第32話開始前までに九十九の撃墜数が10機以上である場合、アルストロメリアが参戦する。
■■追加武装編■■
イオン砲
フラグ1-第28話クリア時に「GEAR本部へ残る」を選択すれば、第29話から使用可能になる。
ストナーサンシャイン、ゲッターファイナルクラッシュ
フラグ1-第27話で巨大ゴール出現後、真ゲッターのHPを30パーセント以下にする。
Gビット、Gビットサテライトキャノン、ツインGビット
フラグ1-第31話（宇宙ルート）終了後に使用可能になる。