サバイバルキッズ２には全部で５（+１）のエンディングが存在する。ここではそのすべてのエンディングへの道を紹介していく。 なお、兄弟を助けずにそれぞれのエンディングは可能で、選択肢や主人公がヤマト、ムサシの違いなど実際のパターンは２０種以上にのぼるのだ。
下記のエンディングチャート部分は炙り出しにした。出来れば最初はこれに頼らずクリアしてほしいと思う。

場所-とうだい
必要アイテム-かんきせん（基地）、モーター（基地）、でんきゅう（灯台）、はりがね（こわれたモーターを分解）

●地下のケーブルが壊れているところで「はりがね」を使う。
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●「かんきせん」を地下のプロペラ位置で使う。（先にこれを設置してしまうと、「はりがね」が設置できなくなる。その場合は、一旦「かんきせん」を外そう）
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●「こわれたモーター」のあった位置にモーターを設置。
●灯台の一番上で「でんきゅう」を設置。
↓
●これで灯台が機能するはず。その後は助けが来るまでひたすら時間を経過させよう。（４〜５日くらいか）
↓
●終わり

場所-ぐんかん
必要アイテム-ドラムかん（基地or軍艦）、かんきせん（基地）、かいちゅうでんとう（合成）

●軍艦内部の地下を進んだところにボートがある。ここに来るためには「かいちゅうでんとう」が必要だ。（これは「でんきゅう+でんち」で作る。「でんきゅう」は灯台、「でんち」は基地の「めざましどけい」を分解）
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●ボートに「ドラムかん」を設置。
●ボートに「かんきせん」を設置。
↓
●終わり

※選択肢が出るが、どれを選んでも脱出できる。兄弟を見捨てる、ハチ（あらかじめハチの巣を落とすといったことも）、パロの助けなどさまざまなバリエーションが存在する。

場所-どこでも（基地以外）
必要アイテム-なし

●基地以外の場所で生存日数が100日になる。
↓
●終わり

場所-基地
必要アイテム-なし

●基地にいる間に生存日数が100日になる。
↓
●終わり

場所-軍艦
必要アイテム-ボルトx4（基地x3、トンネル、【5.8】、軍艦）、てつのいた（【7.6】、【16.10】）、ドラムかんx3（基地x4、軍艦）、12センチほうだん（合成）

●軍艦の地下、穴があいた所を「ボルト」４本と「てつのいた」２枚でふさぐ。
●軍艦の燃料を補充（「ドラムかん」２本）。
●「ほうだん」（軍艦内で入手）と「かやく」（基地で入手）を合成し、「12センチほうだん」を作る。そして軍艦の大砲に込める。
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●軍艦のイカリが上がっているか確認。
●大砲の向きを「←」にする。
●雨が降って、グラグラしている状態を待つ。
↓
●砲弾発射。
↓
●終わり

場所-いろいろ
必要アイテム-なし

●イシモ島の熊が出る洞窟を抜ける。（通信を利用すれば、この部分は省ける）
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●ダイヤモンド入手。
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●ED1〜5、いずれかの条件を満たす。
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●終わり

※全エンディングは、「ヤマトかムサシか」、「兄弟を助けているか否か」、「Sの条件を満たしているか否か」によって微妙に違った展開を見せる（ほとんど同じだけどね）。